Se trata de lagunas altoandinas con alta concentración de sales ubicadas a grandes altitudes. La laguna Santa Rosa es un sistema de humedales conformado por canales y lagunas ubicados a 3.800 msnm, al extremo sur del salar de Maricunga. La laguna del Negro Francisco se encuentra a cerca de 80 kilómetros de distancia de Santa Rosa, a una altitud de 4.100 msnm.
Estos cuerpos de agua también cuentan con vegetación tipo “bofedal” en parte de sus orillas lo que en conjunto, provee de sitios de alimentación, descanso y reproducción a numerosas aves acuáticas.
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